1、培养目标的不同。
专科培养具有专业知识和技能、高级人才，培适应在生产、管理、服务一线和广大农村工作的技术应用性人才其知识的讲授是以“能用为度”、“实用为本”。
本科培养较扎实地掌握本门学科的基础理论，专门知识和基本技能，并具有从事科学研究工作或担负专门技术工作初步能力的高级人才。
2、知识结构的不同。
专科集中于改造认识世界的范畴，是相对完整的实践体系和相对不完整的理论体系的统一。
本科强调课程的整合、学科的完整和综合，注重跨学科知识的迁移。
3、办学模式的不同。
专科教学质量控制体系在校内，开放办学程度要求不高，国际化程度较低，自成体系，较为闭塞。
本科应用成果等多种形式，学术水准要求高，对外开放度较高，社会影响力强。